In den sächsischen Flussniederungen liegen die Hauptbrutgebiete des Weißstorchs. Dazu gehören das Riesa-Torgauer Elbtal, die Muldeauen zwischen Grimma und der nördlichen Landesgrenze ebenso wie die Gebiete an der Großen Röder in der Großenhainer Pflege und der Gröditzer Röderniederung sowie die Oberlausitzer Heide- und Teichlandschaft mit Neiße, Schwarzem und Weißem Schöps, Spree, Schwarzwasser und Schwarzer Elster. In den 1920er-Jahren erreichten die Weißstorchbestände in Sachsen ihren Tiefstand. Damals brüteten Störche, von wenigen Ausnahmen abgesehen, nur noch vereinzelt östlich der Elbe. Die Bestände erholten sich, nahmen jedoch trotz zahlreicher Artenschutzmaßnahmen, u. a. durch das NABU-Naturschutzinstitut Dresden und das Engagement vieler ehrenamtlicher Weißstorchbetreuer, in den letzten Jahren stetig ab und stabilisierten sich auf niedrigem Niveau. Das wiederspiegelt die allgemeinen Probleme des Natur- und Artenschutzes in einer stark industrialisierten, ausgeräumten und intensivierten Landschaft.
Ihre Brutplätze haben sächsische Weißstörche auf Dächern von Gebäuden, Schornsteinen, Gitter-, Beton- und Holzmasten sowie vereinzelt auf Bäumen. Auf Masten und Schornsteinen nimmt die Zahl der Neststandorte zu, während die Zahl der Horste auf Hausdächern abnimmt.